Con el fin de contribuir a la caracterización de la tesis doctoral e identificar diferencias entre disciplinas, exploramos un corpus de textos de Biología y Lingüística, centrándonos en la estructura retórica del capítulo introductorio. El trabajo se inscribe en la línea de los estudios de textos para propósitos específicos y la teoría de la Valoración o Appraisal. El corpus se compone por diez tesis de Biología Molecular y Celular, y ocho de Lingüística (en las áreas de discurso, gramática y lenguas indígenas). Al analizar la estructura retórica del capítulo ‘Introducción’, identificando las movidas y submovidas textuales, y explorando los recursos de la valoración, se observan diferencias entre ambas disciplinas. En Biología, la estructura responde al modelo postulado por J. Swales para el artículo de investigación, pero con un desarrollo cíclico y segmentos adicionales con contenido enciclopédico; en esta sección, los autores despliegan un gran esfuerzo retórico por colocar el trabajo propio en el contexto de las investigaciones previas y, al mismo tiempo, dar cuenta de su solvencia en el tema. En Lingüística, la estructura es variable: se observan los movimientos principales, pero en diferente orden, y se pone más énfasis en justificar el marco teórico y el corpus seleccionado, que en relacionar el trabajo con investigaciones previas. Se podría afirmar que, en el corpus estudiado, el capítulo introductorio posee diferente función en ambas disciplinas. Sin embargo, dado que la función global de la tesis y la situación comunicativa son similares, no es posible afirmar que se trate de géneros diferentes. 